基础医学院前身为创建于1965年11月的咸宁医学院基础学部，2008年7月单独建制。经过四十余年的建设，基础医学院已成为全校基础医学的教学、科研和社会服务基地。
础医学院现有2个专业团队，13个课程群，1个省级基础医学实验教学示范中心，1个生命科学标本陈列馆。其中病理学为省级精品课程，病理学专业开设的“病理在线”网络互动教学平台具有国内先进水平，被多个国内外知名搜索引擎纳入。
基础医学院共开设临床医学、公共卫生管理学和预防医学3个本科专业。学院拥有一批省内外著名的专家学者，现有教职员工118人，其中教授15人，博士10人。享受国务院、省、市政府特殊津贴的专家3人，省有突出贡献专家2人，省跨世纪学科带头人1人，咸宁市高层次人才2人，校学科带头人4人、教学名师1人、十佳教师2人，兼职硕士生导师4人。
基础医学院教学科研力量雄厚。主要从事生物医学领域的基础研究，拥有较雄厚的科学研究综合实力。现有省级基础医学实验教学示范中心1个，专业数码互动实验室8个，仪器设备总值1013万元。建有生命科学标本陈列馆1个，馆藏标本3500余件，按目前巿场行情估价近2000万元，在国内同类院校中处于领先地位；另外，湖北省教育厅批准社会医学与卫生事业管理专业“楚天学者”岗位一个，聘请国外知名学者承担该专业“讲座教授”，力争本学科点研究方向与研究方法与国际先进水平接轨。近三年来，承担各类研究项目60余项，其中省级以上项目25项，可控 研经费840万元；出版主、参编教材及教学参考书15部，获省市奖励的科研成果5项，获国家专利成果1项。学院学术气氛活跃，学术交流活动丰富，成立了“杏林论坛”，经常邀请国内外知名专家学者讲学。
基础医学院质量保障体系完善，管理机构健全。历经30年的本科教育，积累了丰富的教学经验，取得了可喜的育人成果，培养的学生以学风严谨，实践综合能力强，开拓创新潜力大等优点受到社会各界和用人单位的好评。四十余年来，学院已向国家和社会输送各级各类医学人才8000余人，为我国尤其是鄂东南地区的医疗卫生事业做出了积极的贡献。
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